Coincido con monosanhueza. Yo estoy haciendo lo mismo. Para las monedas de plata y/o un poco especiales, cojo cápsulas. El resto las estoy metiendo en cartones autoadhesivos. Lo malo de las cápsulas es que normalmente hay que comprar cajas de 10 de una medida concreta, cosa que no siempre tiene por qué venir bien.
En mi caso, como tengo bastantes de las de 2000ptas y 12€, y espero tener más, he cogido bastantes cápsulas de 33mm y, para el resto, he cogido cápsulas Quadrum, que son cuadradas y tienen una espuma por dentro que recortas con tijeras (usando unas plantillas) según la medida que necesites. Son más caras, pero bueno, a la larga creo que las sacaré más partido.